Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B020011L13RikA0A087WQI7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B020011L13RikA0A087WQI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.7 ms