Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700017N19RikA0A087WPJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700017N19RikA0A087WPJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms