Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm5538W4VSP6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5538W4VSP6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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