Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt27Q9Z320 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt27Q9Z320 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Krt27Q9Z320 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt27Q9Z320 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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