Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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