Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Cldn13Q9Z0S4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn13Q9Z0S4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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