Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nme3Q9WV85 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme3Q9WV85 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme3Q9WV85 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme3Q9WV85 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme3Q9WV85 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme3Q9WV85 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nme3Q9WV85 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms