Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc4Q9QZD4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms