Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnpy2Q9QXT0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnpy2Q9QXT0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms