Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Tmod2Q9JKK7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tmod2Q9JKK7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tmod2Q9JKK7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmod2Q9JKK7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tmod2Q9JKK7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmod2Q9JKK7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms