Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pop7Q9DCH2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pop7Q9DCH2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pop7Q9DCH2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pop7Q9DCH2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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