Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn3Q9DCB1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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