Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pop5Q9DB28 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Pop5Q9DB28 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms