Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms