Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Srp19Q9D7A6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Srp19Q9D7A6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms