Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Borcs6Q9D6W8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs6Q9D6W8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms