Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf128Q9D304 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf128Q9D304 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms