Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pramef12Q9D2F1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Pramef12Q9D2F1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pramef12Q9D2F1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pramef12Q9D2F1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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