Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snf8Q9CZ28 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snf8Q9CZ28 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms