Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms