Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chmp3Q9CQ10 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chmp3Q9CQ10 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms