Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup155Q99P88 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup155Q99P88 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms