Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ddb2Q99J79 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ddb2Q99J79 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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