Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc30a1Q99J38 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc30a1Q99J38 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms