Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms