Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Uhrf1Q8VDF2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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