Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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