Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Znf628Q8CJ78 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Znf628Q8CJ78 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms