Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trip10Q8CJ53 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms