Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfwd3Q8CIK8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfwd3Q8CIK8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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