Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hpf1Q8CFE2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms