Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms