Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rdh13Q8CEE7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Rdh13Q8CEE7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rdh13Q8CEE7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rdh13Q8CEE7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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