Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nup88Q8CEC0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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