Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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