Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ube3dQ8BX13 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms