Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Pggt1bQ8BUY9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pggt1bQ8BUY9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms