Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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