Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Scn4bQ7M729 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Scn4bQ7M729 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn4bQ7M729 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Scn4bQ7M729 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Scn4bQ7M729 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn4bQ7M729 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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