Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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