Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp8b3Q6UQ17 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp8b3Q6UQ17 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms