Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms