Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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