Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbm38Q62176 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms