Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkciQ62074 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkciQ62074 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms