Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rai1Q61818 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rai1Q61818 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rai1Q61818 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rai1Q61818 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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