Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms