Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trp53i11Q4QQM4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trp53i11Q4QQM4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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