Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pydc3Q3V3Q4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms