Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rbm44Q3V089 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rbm44Q3V089 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm44Q3V089 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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